yessie, si quieres eliminar esas filamentosas debes de empezar a pensar en medir parámetros, o al menos nitratos y fosfatos, por ahí le estamos dando una via de alimentación, tambien influyen los silicatos, pero en menor porción, por otro lado tambien sería bueno que se recubriese la roca de calcarea imposibilitando la floraqción de la filamentosa y para eso buenos niveles ni calcio, Kh y magnesio, teniendo un buen equilibrio de éstos 3 valores mas los otros dos te garantizo que tus filamentosas irán retrocediendo, todas formas al incorporar agua nueva y sustrato nuevo es normal que te ocurra ésto, aunque hayas introducido ya sustrato curado ahora tienes un nuevo ciclado con el recienincorporado nuevo sustrato.