Hola Vander.
Es una buena pregunta que muchos nos hemos hecho en algún momento.
Realmente dependerá de las condiciones de tu acuario particular. Pero casi cualquier acuario puede aguantar perfectamente unos días con el skimmer desconnectado sin sufrir.
Yo he tenido un acuario funcionano unas tres semanas con el skimmer apagado. Al final de este tiempo estaban apareciendo algas y no me gustaba nada una capa de proteinas que se formaba en la superficie del agua, pero el estado general del acuario estaba bien.
Tambien se pueden montar acuarios sin skimmer. Es lo que se llama el método natural o filtración natural. En estos casos es imprescindible una filtración biológica adecuada y una bio-carga reducida además de practicar religiosamente cambios de agua parciales.