La roca muerta no tiene restos orgánicos, al contrario es la roca viva la que tiene restos orgánicos muertos que sirven como alimento a las bacterias. Así que el nitrato teoricamente no procede de tu roca. Si el agua del grifo tampoco tiene nitratos, tendrás que pensar en otras cosas que hayas introducido en el acuario que provoquen esos valores de nitratos. De cualquer forma, como te dice Rafa no te rayes, y piensa que tienes que hacer un ciclado como mínimo de 1 mes en el que irás aditando comida para las bacterias (lo más facil es de los alimentos que tengas para los futuros peces) hasta que las bacterias se hayan multiplicado lo suficiente para conseguir que todo el amoniaco se transforme en nitrito y todo el nitrito en nitrato. El nitrato ya no es tóxico para los peces, entonces tendrás que cuidar que los valores de nitrato no sean muy elevados (mediante los diversos sistemas de reducción de nitratos como son el skimmer, no aditar más alimento del que precisen los peces, biobolas, refugio de algas, marine pure o similar, etc) y ajustarlos según vayas introduciendo tipos de corales. Me parece de muy mala praxis profesional que te hayan dicho en una tienda que metas un pez antes de hacer el ciclado, eso no se aconseja en ningún documento serio de acuariofilia. Paciencia que en poco tiempo tendrás el acuario preparado para irle introduciendo invertebrados, peces y corales y disfrutar de ver como se va poblando de animales y tomando color.
