Una solución casera sería:
2 bombas iguales
2 temporizadores
2 recipientes
En un recipiente ira el agua que saques del acuario, y en otro el agua que quieres introducir en el acuario. Una bomba sacará el agua durante un tiempo determinado al recipiente 1, y cuando esa bomba finalice la otra bomba introducirá el mismo tiempo agua salada desde el recipiente 2. Creo que es la forma más facil de solucionar los cambios de agua.