Si quieres erradicarlas de forma natural te aconsejo que tengas mucha paciencia,no son faciles de eliminar pero no imposible,deberias de sifonarlas y añadir depredadores como pueden ser el Halichoeres marginatus (el mas eficaz) chrysus o trispilus,un Hexataenia puede ayudar con las más pequeñas.
En caso de hacerlo quimicamente hay varios productos eficaces pero lo mas importante es eliminar las toxinas que sueltan al morir las planarias por lo que tienes que tener preparado cantidad de carbón para eliminar sus efectos toxicos en los animales.
Suerte compañero.
Saludos.