Depende de qué tipo de vida tenga, cómo esté de sucio el que ya tienes, de qué granulometría es y de la profundidad que tenga.
Si tienes una capa de arena de poco espesor, limpia y con poca vida no tienes ningún problema en echar la nueva arena como quieras.
Si el sustrato tiene cierto espesor, tiene organismos vivos que se han estratificado en capas. En las más superficiales viven los que necesitan oxígeno para vivir. Al poner más sustrato encima les retiras el oxígeno a los organismos que lo habitan y algunos pueden morir aunque la mayoría sabrán ascender por la arena sin mayor problema. Mejor echarla en varios días en capas finas.
Hay un posible problema, aunque es difícil que se presente. Si hay mucha materia orgánica en el sustrato actual y la entierras con una capa de gran espesor de arena fina, que no permita demasiado la penetración de oxígeno, se puede formar sulfuro de hidrógeno. La materia orgánica al descomponerse en un ambiente sin oxígeno genera este gas con el olor característico a huevos podridos y color negro. Es un gas muy tóxico. Tendrías que sifonar la arena para limpiarla de materia orgánica, aunque al hacerlo eliminarás muchos de los organismos que tenga.
Un saludo.