Hola Manlor y Joan Xavier: una discusión muy interesante en la que creo que ambos tenéis razón, pero la medida en que los procesos mencionados son aplicables a un acuario puede variar mucho. Joan Xavier, en última instancia tienes razón cuando dices que la desnitrificación elimina totalmente el nitrato para convertirlo en nitrógeno molecular (N2), y que por el contrario los fosfatos acaban mineralizándose y pueden ser devueltos a la columna de agua. Pero la dinámica de esos procesos varía mucho de unos acuarios a otros y varía también respecto de lo que ocurre en la naturaleza. Para que la desnitrificación sea totalmente efectiva es necesario tener poblaciones de bacterias (Proteobacterias) que la lleven a acabo, en condiciones anaerobióticas o de muy baja tensión de oxígeno. Dado que estas bacterias son heterótroficas, requieren de una fuente de carbono, que suele ser el factor limitante en un acuario (el fosfato no suele serlo, desgraciadamente). Por lo tanto, si tenemos un substrato que proporcione zonas de baja concentración de oxígeno, bacterias desnitrificantes y fuente de carbono (todo ello constituye la base de los métodos probióticos de reducción de nutrientes), conseguiremos la eliminación efectiva de nitratos.
Los fosfatos son más complicados porque, como bien dices, no desaparecen, como es el caso del nitrógeno molecular. Los fosfatos retirados de la columna de agua por los organismos vivos que los utilizan para formar macromoléculas (proteínas, ácidos nucleicos, etc.) permanecen en éstas y en los seres vivos que las contienen. En consecuencia tenemos dos opciones. Retirar esos organismos vivos, o bien dejar que mueran en el acuario y continúen el ciclo para la mineralización. Las poblaciones bacterianas que eliminan nitratos se multiplican y acumulan fosfatos, pero a menos que retiremos esas bacterias (bien porque sean utilizadas como comida por otros organismos del acuario o bien por el espumador) el fosfato que contienen volverá al acuario cuando mueran.
Por ello, una opción muy interesante es retirar nutrientes por "cosechado" de los organismos vivos que los acumulan. Los scrubbers de algas funcionan así, y es una opción que quiero explorar, porque en mi caso, al igual que les ocurre a muchos, la eliminación de nitratos por métodos probióticos bacterianos no lleva aparejada una eliminación efectiva de fosfatos.
Saludos