D2, nunca he usado carbón en el acuario, a lo máximo alguna resina y no me acuerdo desde cuando no la he vuelto a usar, prefiero los cambios de agua y un buen filtro u.v.
No con ésto digo que no se deban usar, como es en tu caso para aclarar el agua, cosa que no tendría que porqué oscurecerse el agua, si todo va bien, ahi momentos en que sí, en que el agua coge un pequeño color verdoso debido a esporas de algas en suspensión o mucho peor, un desequilibrio bacteriano, pero no mas tiene porqué coger color el agua.